Определение способа взаимодействия антибиотика с белком-целью позволило разработать новый способ борьбы с резистентными «супербактериями».
Исследовательская команда, состоящая из химиков и молекулярных биологов выяснила, как природный антибиотик лактивицин взаимодействует с белками бактерий.
Практически все антибиотики поражают бактерии, связываясь с пенициллин-связывающим белком [penicillin-binding protein (PBP)] клеточных стенок. Тем не менее, PBP ряда бактерий мутировали в формы, не связывающиеся с лекарствами.
Действие лактивицина, открытого японскими учеными в 80-х годах ХХ века также основано на связывании с белком PBP, однако в отличие от всех ранее использовавшихся антибиотиков в молекуле лактивицина не содержится альфа,бета-лактамовое кольцо.
Международная исследовательская команда, состоящая из британских, французских и бельгийских ученых с помощью рентгеноструктурного анализа впервые показала, каким образом белок PBP взаимодействует с лактивицином и его производным фенокисацетиллактивицином. Они также продемонстрировали, что пневмококковые бактерии, резистентные к антибиотикам, в структуре которых содержится лактамовое кольцо, беззащитны к действию лактивицина.
Самой важной частью работы была визуализация взаимодействия лактивицин-PBP. Полученная кристаллическая структура выявляет те фрагменты в активном центре фермента, к которым можно подобрать блокаторы для разработки новых, более совершенных антибиотиков. Руководитель британских химиков, работавших над проектом, Кристофер Шофилд (Christopher Schofield) из Университета Оксфорда отмечает, что данные кристаллографии укажут на то, как функционализировать молекулы для повышения их антибиотической активности.
