Институт физиологически активных веществ РАН в составе Ногинского научного центра РАН в г. Черноголовка был создан в соответствии с решением директивных органов и организован приказом Президиума академии наук за № 933 от 14 сентября 1978 года. Научно-методическое руководство Институтом было возложено на Отделение биохимии, биофизики и химии физиологически активных соединений АН СССР.
Решением Президиума АН СССР были определены следующие основные направления научной деятельности Института:
поиск, химический синтез, изучение строения и связи между химической структурой и физиологической активностью синтетических и природных физиологически активных веществ (ФАВ);
исследование физиологической активности полученных веществ на биологических моделях и животных, изучение механизмов проявления физиологической активности;
разработка систем поиска и оценки эффективности применения ФАВ с использованием биохимических и физико-химических методов, а также разработка рекомендаций по их практическому использованию в медицине, сельском хозяйстве и в других отраслях экономики.
Директором Института был назначен доктор химических наук профессор Иван Васильевич Мартынов, крупный организатор фундаментальных и прикладных исследований и новых химических производств в системе Министерства химической промышленности СССР, Лауреат Ленинской премии (1972 год), Герой социалистического труда (1974 год), кавалер 27 орденов и медалей. Название Институту было предложено его первым директором.
