Учреждение Российской академии наук Институт биоорганической химии РАН был основан в 1959 году и первоначально назывался Институтом химии природных соединений. В 1970 году Институту было присвоено имя его основателя — академика М.М. Шемякина, а в 1992 году — имя академика Ю.А. Овчинникова. С 1988 г. Институт возглавляет академик В.Т. Иванов, известный своими исследованиями в области структуры и функций пептидов — универсальных биорегуляторов, играющих ключевые роли в биохимических процессах.
В настоящее время ИБХ РАН — это крупнейший центр физико-химической биологии и биотехнологии в России. Он входит в состав Отделения биологических наук Российской академии наук и возглавляет проведение работ, связанных с химическим изучением живой материи. В нём проводятся исследования молекулярных механизмов различных процессов жизнедеятельности, их практического использования в интересах медицины и сельского хозяйства, а также разрабатываются фундаментальные и прикладные аспекты биотехнологии.
Разместившийся в Москве на улице Миклухо-Маклая д. 16/10 комплекс зданий ИБХ РАН является уникальным сооружением, предназначенным для многоцелевых фундаментальных научно-исследовательских работ. В Институте находятся современная комплексная установка для разработки технологий получения и выпуска новых лекарственных средств и препаратов для сельского хозяйства, а также специализированные генно-инженерный и изотопный блоки.
Филиал ИБХ РАН располагается в г. Пущино Московской области. В его состав входят исследовательские лаборатории, уникальные станция искусственного климата с лабораторией клонального микроразмножения растений БИОТРОН, научно-производственный комплекс для доклинических исследований медицинских препаратов БИОЦЕНТР и экологически чистая установка для термического уничтожения отходов химических и биохимических исследований.
В Институте и его Филиале работает около 1100 человек, в том числе более 500 научных сотрудников (из них 350 докторов и кандидатов наук). Научные труды ИБХ РАН в области физико-химических свойств пептидно-белковых веществ, нуклеиновых кислот и липидов, в области изучения механизмов функционирования биологических мембран, а также исследования структуры и биологического действия низкомолекулярных биорегуляторов (стероидных гормонов, антибиотиков и т. п.) во многом определили уровень этих исследований в России и за рубежом. Значительный цикл работ Института посвящён практическим аспектам, имеющим важное значение для медицины, сельского хозяйства, ряда отраслей промышленности. Академикам Ю.А. Овчинникову и В.Т. Иванову за создание нового класса мембранных биорегуляторов и исследование молекулярных основ ионного транспорта через биологические мембраны, академикам М.Н. Колосову и Е.Д. Свердлову за цикл работ по молекулярной биологии и молекулярной генетике присуждены Ленинские премии в области науки и техники. 36 сотрудников ИБХ РАН удостоены Государственных премий, 27 — премий Правительства Российской Федерации. За достигнутые успехи и большой вклад в развитие физико-химической биологии Институт в 1981 г. награждён орденом Трудового Красного Знамени.
Сотрудниками ИБХ РАН были разработаны технологии получения препаратов и тест-систем для медицины и сельского хозяйства, в том числе:
Для подготовки научных кадров по физико-химической биологии и биотехнологии в Институте (с 1982 г.) и его Филиале (c 1995 г.) успешно работает Учебно-научный центр, в котором ежегодно проходят обучение более 250 студентов старших курсов ведущих вузов страны. Сотрудники Института читают лекции студентам вузов и проводят семинары. Лучшие из выпускников имеют возможность продолжить обучение в аспирантуре ИБХ РАН. Каждый год в феврале месяце УНЦ ИБХ РАН проводит зимние молодёжные научные школы для студентов и аспирантов.
Постоянно развиваясь, обновляясь и совершенствуясь, Институт старается своевременно отвечать на запросы жизни и времени. И хотя нерешённые проблемы всегда остаются, поиск нового является главной целью всех, кто здесь работает и творит.