Ученые из США теперь могут сравнивать эффективность «молекулярных боеголовок», способных инактивировать белки.
Хромофор-ассистируемая световая дезактивация [chromophore assisted light inactivation (CALI)] белков заключается в инициируемой светом генерации частиц, отличающихся крайне высокой реакционной способностью (часто – синглетного кислорода) при посредстве хромофора («молекулярной боеголовки»). Реакционноспособные частицы повреждают белок-цель, нарушая его биологические функции.
Томас Кодадек (Thomas Kodadek), биохимик из Университета Техаса поясняет, что процедура CALI может использоваться для остановки функции белка в целях обоснования выбора фармацевтических целей или для альтернативного контроля процесса временной дезактивации свойств белка, что необходимо для изучения его биохимических свойств.
Часто эффективность органических хромофоров для использования в качестве «боеголовок» CALI обуславливается их способностью вступать в реакции с выделяющимися реакционноспособными частицами. В новом исследовании Кодадек с соавторами разработал систему для сравнения эффективности «боеголовок». Различным типам хромофоров «позволяется» ковалентное связывание со стандартным белком-целью, что позволяет измерять остаточную активность белка-цели и сравнивать эффективность хромофоров.
Сравнительные эксперименты показали, что хромофор на основе рутенийорганического соединения оказываются более эффективными «боеголовками» в сравнении с обычно используемым флуоресцеином. Было продемонстрировано, что рутенийорганика свободно проникает через клеточную мембрану и дезактивирует целевой белок, что позволяет использовать эту «боеголовку» для проведения процедуры CALI как на живых клетках, так и на клеточных экстрактах.
